In teoria non potresti perche' il momento impositivo per l'applicazione dell'IVA (e pertanto dell'emissione della fattura) è la consegna della merce o l'incasso di denaro (per acconti o prestazioni di servizi effettuate); ma in pratica lo fanno in molti per il motivo che hai enunciato tu (presumo sia vostra politica consegnare la merce solo previo l'incasso del corrispettivo).
Meglio sarebbe se emettessi fattura e consegnassi contestualmente la merce anche prima di ottenere il pagamento della fattura.