Riferimento: Compensazione iva
per fare la compensazione Iva, devi riportare all'interno dell'F24 prima il credito maturato cod.trib. 6099 e poi l'importo da pagare (iva a debito) cod.trib 6003. Nel caso in cui il credito fosse inferiore al debito, la differenza puoi tranquillamente versarla...