Per i fabbricati commerciali, l'opzione per l'Iva, sia per la locazione che per la vendita, consente alle società proprietarie di mantenere, a regime, l'imposizione Iva, con il diritto di detrarre l'imposta assolta a monte. Tuttavia è previsto il pagamento dell'1% per le locazioni, anche finanziarie, e di un'imposta ipo-catastale del 4%, da pagare alla vendita o al riscatto.
Per i contratti di locazione in corso alla data di entrata in vigore del decreto, le parti devono presentare per la registrazione una dichiarazione dove può essere esercitata l'opzione per l'Iva, con effetto dal 4 luglio 2006.